对于搜索引擎来说，它所提供的信息服务的内容就是用户搜索的结果。综合搜索引擎与垂直搜索引擎的最大区别在于模糊搜索与精准搜索，例如百度搜索（综合搜索引擎）一个关键词，会出来一些相关性不是很强的搜索结果，而在淘宝内搜索（垂直搜索引擎）一个宝贝，出来的必定是相关的宝贝。
综合搜索引擎提供的搜索结果仅仅是网页链接和关于该网页的简单描述，其中匹配的原则是网页描述与关键字的相关度。而垂直搜索引擎提供的搜索结果是结构化的数据，几乎不需要用户具体打开网页就可以断定是否是自己需要的结果。
综合搜索引擎是按照系统设定的排序算法，自动根据相关性将网页排列，它的用户不能自主选择排列方式，只能被动的接受搜索引擎的排列顺序；而垂直搜索却能根据用户自己的意愿进行原则，以淘宝为例，搜索结果可以选择以“价格”或者以“人气”或者以“销量”进行排列。
综合来说，垂直搜索引擎优势在于覆盖面广阔、信息量巨大，缺点是不能完全精确定位搜索；而垂直搜索引擎优势在于准确率高、选择性强，缺点是覆盖面窄、信息量小，一般搜索结果就几百个左右。所以综合搜索引擎一般单独的用于搜索（如百度），而垂直搜索引擎一般在大型网站内部使用（如淘宝搜索）。